Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
STRCQ7RTU9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
STRCQ7RTU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
STRCQ7RTU9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms