Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYFIP1Q7L576 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYFIP1Q7L576 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms