Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY3Q7L099 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUFY3Q7L099 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms