Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP31Q70CQ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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