Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAXIP1Q6ZW49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAXIP1Q6ZW49 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms