Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC129Q6ZRS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms