Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms