Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAMDC4Q6UXC1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MAMDC4Q6UXC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms