Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM1Q6UX27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM1Q6UX27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms