Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC171Q6TFL3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms