Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLRE1AQ6PJP8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1AQ6PJP8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms