Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C22orf39Q6P5X5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C22orf39Q6P5X5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C22orf39Q6P5X5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms