Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CGB2Q6NT52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGB2Q6NT52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGB2Q6NT52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms