Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATL3Q6DD88 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL3Q6DD88 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL3Q6DD88 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms