Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPECC1LQ69YQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPECC1LQ69YQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPECC1LQ69YQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms