Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF3Q5VWG9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms