Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms