Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01545Q5VT33 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01545Q5VT33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms