Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN1Q5VSR9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms