Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRIP1Q5VSL9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms