Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms