Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF5Q5TYX0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms