Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FRMPD1Q5SYB0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FRMPD1Q5SYB0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms