Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HABP4Q5JVS0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms