Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SFT2D3Q587I9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D3Q587I9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms