Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL22Q53GT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms