Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms