Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHLDA2Q53GA4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms