Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4orf17Q53FE4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms