Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC9B1Q4ZJI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9B1Q4ZJI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms