Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM259Q4ZIN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM259Q4ZIN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms