Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A4Q4VNC1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A4Q4VNC1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms