Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms