Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2CQ496J9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms