Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC153Q494R4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC153Q494R4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms