Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF260Q3ZCT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms