Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-2Q3LI59 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms