Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDRF1Q3B7T1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms