Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL38Q2WGJ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL38Q2WGJ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms