Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
QSER1Q2KHR3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms