Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MICAQ29983 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MICAQ29983 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MICAQ29983 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MICAQ29983 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MICAQ29983 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MICAQ29983 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MICAQ29983 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms