Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LONRF1Q17RB8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LONRF1Q17RB8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LONRF1Q17RB8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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