Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTL8BQ17RB0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RTL8BQ17RB0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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