Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDO1Q16878 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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