Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFKFB3Q16875 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms