Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCK2Q16822 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCK2Q16822 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms