Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTF1Q16619 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTF1Q16619 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTF1Q16619 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTF1Q16619 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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