Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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