Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USF2Q15853 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
USF2Q15853 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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