Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA6Q15825 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA6Q15825 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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